Создатель и главный директор корпорации «Кайба», приёмный отец Сэто и Мокубы. Взял их из приюта после того, как Сэто одолел Годзабуро в шахматах. Однако его методы воспитания детей были слишком суровыми, у детей не было времени на отдых и игры. Сам Годзабуро желал сделать из своей корпорации военную систему, способную уничтожить весь мир.
спойлер
Чтобы проверить, может ли Сэто быть руководителем корпорации, он отдал ему часть своих акций в долг. Но Сэто удалось обмануть своего отца, после чего он от отчаяния совершил самоубийство. Годзабуро является родным отцом Ноа, которого поместил в виртуальную систему, после того как Ноа погиб, когда в него врезалась машина.
