Ну как я понял да, без влияния made in heaven.
Фаны тоже на jojo wiki написали, что Эмпорио все помнит
jojo.fandom.com/wiki/Stone_Ocean

да Эмпорио единственный кто всё помнит в новой вселенной, у других просто теперь личности и судьбы другие, считай, что ДжоДжо есть, но их и нет - это теперь обычные люди