После изменения:
История разворачивается в Кивотосе – городе, состоящем из тысяч академий, которыми руководит Генеральный студенческий совет. И вот, в один прекрасный день президент совета объявлен пропавшим без вести и город стремительно охватывает беспорядок.
Генеральный студенческий совет обращается за помощью к Федеральному бюро расследований S.C.H.A.L.E., основанному президентом незадолго до исчезновения.
Взять на себя ответственность по восстановлению порядка в городе предстоит Сэнсэю – таинственному учителю, недавно прибывшему в город по просьбе президента. Вступив в должность главы S.C.H.A.L.E., Сэнсэй получает первое задание – помочь ученикам академии Абидос уберечь ее от угрозы закрытия.
Сможет ли Сэнсэй вместе с учениками преодолеть надвигающиеся трудности, спасти академию от закрытия и раскрыть тайны города?