1) В книгах более подробно про ношение оружия и пользование им у воронов, а также про то, как с этим было у Юкии. Там в обезьяньи пещеры он пошел в нижней одежде из паучьего шелка дзёрогумо на перья (путеводная нитка - из него) и с мечом господина, причем меч короткий, но боевой, в отличие от обычного церемониального, это оговорено особо. Меч Юкия оставлял только на берегу подземного озера, чтобы не мочить, и на обратом пути взял с собой.Так что здесь ошибка сценаристов аниме, видимо, несостыковки оттого, что текстовые разъяснения и детали не поместились. А в Овраге свои законы и другое отношение к оружию, там все бойцы-бандиты.
2) 3 лапа не декоративный элемент. Они её получили от Ямагами по наследству, как и способность к оборотничеству. И ещё - родятся ятагарасу из яиц, т.е. мать оборачивается , сносит яйцо, высиживает сама или наседки-няньки, у богатых и знатных. Вылупляется птенец и остается таким до года, его берегут от переохлаждения и не показывают отцу пока не сможет превратиться в человека.
3) Может, еще у людей еду воровали, и питались плодами, они не все поголовно были людоедами, и у них был выход из пещер в Японию, к людям, в отличие от воронов. У воронов есть опосредованная торговля с людьми во внешнем мире, через один-единственный выход из горы - через тэнгу, которые живут в человеческом облике среди людей. Выйти наружу в человеческом облике вороны не могут, за исключением Истинного Золотого. Вещи из внешнего мира через барьер тоже не проходят, портятся и ломаются. Об обезьянах вороны не то чтобы не знали, ранее Истинные Золотые лично ходили к Ямагами и поклонялись ему в пещерах, значит с частью приближенных к нему обезьян имели дело. Но вороны об обезьянах "забыли" и вычеркнули из своей истории где-то лет 100-200 назад, когда тогдашний Истинный Золотой, предшественник Надзукихико, увидел, как Ямагами пожирает не угодивших ему человеческих жриц, доставленных обезьянами из внешнего мира.Он закрыл священный ход к божеству ценой своей жизни, даже его останков не нашли в пещерах и не похоронили по церемониалу, так что на нем прервалась цепочка родовой памяти Истинных Золотых (поэтому Надзукихико - немного неполноценный Истинный Золотой, части родовой памяти ему не хватает). А обезьяны затаили злобу, т.к. изначально Ямагами предпочел им воронов и какое-то время пытался насильно тоже приохотить обезьян к "человеческому" образу жизни, а они хотели жить независимыми животными-ками и принимать от людей подношения за дарование дождя, как было в тех местах издавна.Обезьянам не нравилось, что вороны стали больше людьми, чем птицами, они ненавидели именно человеческую их форму. На людей охотились, видимо, тоже из-за того, что он них, как богов дождя, люди отвернулись, стали поклоняться Ямагами. Говорить некоторые обезьяны могли, но очень плохо, их дети могли , например, друг друга позвать по имени, и только.