@Роман Кушнир, Насчет глупости отдельных высших офицеров, нет смысла придираться, поскольку в этом нет ничего странного, командир глупый да, что поделаешь, нужно подчинятся, это не выдумки или ошибки в логике со стороны авторов. В моем любимом , например, такое встречалось очень часто, генерал, самоуверен, не слушает советников, опирается на свою храбрость, недооценивает возможности противника, и с большой вероятностью терпит поражение. Относись к этому, как к просто старому литературному штампу, либо как к реальному факту существования таких командиров, ирл примеров думаю нетрудно найти, (но мне лень это делать).
И про то, что Ян отпустил имперцев. Он в первую очередь человек, и для него убивать простых солдат - зверство. Если не нравится такой подход, то можно найти объяснения его поступка, улучшить имидж альянса, например, показав их великодушие?, смягчить отношения между империей и альянсом? , тут к логике не должно быть вопросов совсем, как по мне.
А вопросы по типу, почему такая херовая система безопасности, можно взять как условность, аниме то даже с этими логическими ошибками отличное.