Знакомство с Нагисой и её семьей, и время проведенное с ними в некотором смысле помогло побороть проблемы Томои, а смерть Нагисы вызвала регрессию психики, в том числе и "откат", то есть потерю всего, что Томоя приобрел со своим опытом пребывания в нормальной семье, включая ощущение психологической опоры, которая давала какие-то эмоциональные силы двигаться по жизни и находить в ней смысл. А учитывая тот факт, что детство было у него не самым радужным, то эта регрессия в совокупности с трауром и потерей своей идентичности просто неизбежно должны были вогнать его в тяжелейшее состояние, где человек уже не способен адекватно воспринимать действительность и самостоятельно выбраться из этого состояния. Как ты мог видеть, полностью осознал своё поведение он лишь после того, как прошло достаточно времени, с помощью родителей Нагисы и после разговора со своей бабушкой по отцу. Лично мне гораздо больше верится в то, что показали в аниме, чем если бы человек после всего произошедшего просто способен был подумать о том, что не хочу быть как свой отец и сразу как ни в чем не бывало продолжил бы в прежнем ритме, самостоятельно занявшись воспитанием дочери.