Один из сильнейших автоботов. Ультра Магнус появляется на Земле самым последним из автоботов. Но, несмотря на принадлежность к автоботам, он не спешит вступать в команду ни к Оптимусу Прайму, ни к Мегатрону. Почти сразу по прибытии, он нападает на «БРАТЬЕВ-АВТОБОТОВ», а потом на Оптимуса. Но Оптимус не собирается отвечать Магнусу ударами на удары — ведь Магнус для него как брат. В свою очередь, Магнус говорит, что преданность автобота он оставил на Кибертроне, когда покинул его.
спойлер
Оказалось, что Оптимус и Магнус были претендентами на место лидера автоботов. Магнус считал себя более достойным, но Матрица выбрала лидером Оптимуса. Магнус прибывает на Землю, чтобы забрать Матрицу (если понадобится, то и силой). Поврежденный Магнусом Оптимус укрывается на небольшом острове, где его находят предаконы и десептиконы. Следом за ними появляется и Ультра Магнус. Он притворяется, что хочет помочь, а сам силой заставляет Оптимуса объединиться в Омегу Прайма. Но Магнус не учёл, что сила Омеги принадлежит и Оптимусу. В конце концов, Оптимус берёт верх над Магнусом и Омега Прайм побеждает предаконов и десептиконов. Оптимус не держит зла на Магнуса, тот в свою очередь начинает задумываться о присоединении к Оптимусу, но с решением не торопится. Позднее, Магнус ещё не раз помогает автоботам в битвах. В одной из них он усиливает «БРАТЬЕВ-АВТОБОТОВ», но сам не понимает, как именно он это сделал (возможно, часть энергии Матрицы передалась Магнусу).