Произошедший взрыв на фабрике, которая производит генетически-модифицированные продукты, оставил за собой утечку особого вируса. После данного инцидента в человеческом мозгу происходят различные мутации, способные выявлять монстров и призраков. Некоторым монстрам люди дали название «фантом». Обладателями особых способностей, с помощью которых можно противостоять им, стали только дети с мутацией мозга, рождённые до и после инцидента. Ученики академии Осия — одни из этих детей: главный герой Харухико Итидзё; умело управляющая духами пяти элементов Май Каваками; Рэйна Идзуми с особой способностью, названной «Пожиратель Фантомов»; сражающаяся в одиночку Който Минасэ. Все они жили обычной школьной жизнью, полной радости и горя, пока не узнали шокирующую правду об этом мире.