По-моему никто просто не понял, что это за аниме, какая у него связь с оригинальной аркой и зачем его смотреть.
Открою небольшой "секрет". Как и вся арка Меланхолии Харухи, данное аниме скрывает нераспакованный многоуровневый архив информации, не видя и не зная которой, простой зритель видит только яркую пустышку романтической комедии, не связанной с каноничной франшизой, в которую зачем-то вовлекли знакомых персонажей.
А ведь Исчезновение Нагато-тян является вполне логичным дополнением к Исчезновению Меланхолии Харухи, раскрывая по сути планы и мотивы главного злодея и давая новую, в чём-то неожиданную точку зрения на происходящее во вселеннной Харухи.
Но как зритель имеет свои требования к аниме, так и аниме имеет требования к своему зрителю.
Вот например, один из ключевых эпизодов.
Книга кстати называется "Наследуй звезды" автор Джеймс P Хоган. Читали?
Или просто пропустили этот эпизод мимо, как что-то незначительное?

Поэтому большинство зрителей и заняло относительно аниме позицию лисы из басни "Лиса и виноград". Впрочем и Меланхолию то честно говоря, по этой же причине, никто толком тоже не смотрел...