Во-первых, первая серия сбила с толку, так как этой истории не было в манге. Но опять же это не критично и вообще меньшее из зол.
Во-вторых, огорчило, что мало внимания уделили деталям, которые, как мне кажется, более полно раскрывают историю. Например, история про грейпфрут. Здесь не только изменили детали, тут вообще сильно сократили историю и преподнесли ее в другом ключе. В манге братья Мориарти не просто травят гнусного аристократа под предлогом вкусного десерта, они детально продумывают план, воздействуют не на одного человека, а на людей в целом и вынуждают его самого захлопнуть капкан, причем показано это как-то более изящно, что ли. Что уж говорить о характере Мишель, которая в манге как-будто более собранная и ее отношение к грейпфруту, который выращивает муж, мне тоже показалось очень важным именно с точки зрения лучшего понимания атмосферы и персонажа. В аниме этого нет. Помимо этого, в деле Хоупа почему-то не упомянули одно из доказательств Холмса, а именно - личное знакомство Дреббера и убийцы, из-за чего тело и было так расположено. В целом, если придираться, то думаю, еще много деталей являются некой "отсебячиной", но тут скорее для меня это не очень-то плюс. Возможно такая подача для кого-то будет наоборот интереснее.

Взять хотя бы случай на "Ноевом ковчеге", когда в манге аристократ сам спрыгнул в воду, так как это было его решение, и в аниме, где его буквально столкнули и он осознал кто за этим стоял. С этой точки зрения, как мне кажется, сюжет из манги был лучше, так как мы сразу видим и понимаем уровень Мориарти, а потому переделывать сюжет в адаптации ради лишней ухмылочки Мориарти не имело какого-то особого смысла.