Момент с 1 сезоном, что после 16 серии по большей части всё идёт не по манге и является отсебятиной тех, кто рисовал аниме, т.к. манга на том моменте не продолжалась ещё. Соответственно 2 сезон уже по манге, и все события, начиная с суда над Окамурой Рином - отличаются. В моём понимании так всё же лучше, так как всё равно лучшая часть первого сезона - это первые 2/3, а дальше начинается сумбур с вкраплениями неплохих идей, которые были впихнуты в уж очень узкий хронометраж одного сезона. Короче, первые16 серий 1 сезона, и все последующие сезоны - канон
В чём-то ситуации похожа со Стальным Алхимиком, правда я бы всё же сказал, что тут не получится сказать, каноничный и не каноничный варианты развития историй равны по качество, и канон всё же лучше в случае с Синим Экзорцистом, ибо финал ну очень поспешный у них получился в 1 сезоне.