...если верить тому объяснению, которое было дано во второй серии (и чуть позднее), у них должно было остаться (исходное) пусть и израненное в результате ДТП тело Аики (они с помощью агрегата в "эпицентре" удачно восстановили его). Из этого израненного тела (в начале истории) они вытащили мозг что бы "засунуть этот живой мозг в синтетическое тело", но попутно (после пересадки мозга) они УДАЧНО провернули эксперимент по "копированию сознания" из живого мозга в мозг синтетический (если информация в 2й половине сериала верна). По идее - всё ок, можно вынимать синтетическое тело с живым мозгом - оно не померло и узнаёт свою родню, но... начинается жесть:
К "системе" (через сеть) подключают "скрипачку" (дочь учёного глав.гада, хотя, возможно она и раньше была подсоединена, но сбой произошёл именно тогда) и "субстанция", из которой сделано тело Аики (в которую засунули живой человеческий мозг) начинает бесконтрольно расти и жрать всех подряд. Синтетическую оболочку (тело с маркировкой 2й версии) с синтетическим мозгом (с копией сознания Аики внутри) экстренно эвакуируют из комплекса. Мать и брата Аики "субстанция" изолирует в коконе (и они торчат там больше года точно). На этом моменте я (чес говоря) присвистнул - "субстанция" сама создала рабочую систему длительной поддержки жизни человека.