@htcmobila-chan, «Евангелион» начался как хорошая научная фантастика, представляющая стандартный сюжет о роботах, с ароматом иудейской и христианской религий. Благодаря качественной графике, необычной для аниме детализации произведения и достаточно точной передаче общественных проблем той эпохи, к январю 1996 года сериал заслужил славу величайшего шедевра со времён Mobile Suit Gundam. По ходу оценки реакции аудитории на развитие сюжета, автор решил полностью изменить концепцию сериала и с 16 серии отклонился от стандартного сюжета, ведущего к счастливому концу. Это вызвало волну критики со стороны аниме-фанатов, не способных вынести истории о страдающих персонажах. Шок вызвали и последние два эпизода, отбросившие все предшествующие загадки и сконцентрировавшиеся на психологии главного героя Синдзи.

В течение двух лет после своего выхода, в 1996 и 1997 году, сериал удерживал первое место в гран-при журнала Animage. В 1998 году полнометражный фильм The End of Evangelion занял в данном гран-при первое место, а Death and Rebirth — 19-е. Аниме-мир не хотел слышать ни о чём, кроме «Евангелиона». Фанаты моментально влюбились в новое спорное творение Gainax, включающее в себя уникальный дизайн боевых роботов, персонажей и загадочную историю. Возросшая популярность произведения обогнала все другие работы, включая Sailor Moon и DragonBall Z. Многие требовали признать «Евангелион» лучшим аниме из когда-либо созданных. Сериал стал центром огромных споров среди фанатов, и о нём можно услышать такие эпитеты, как «колоссальное и завершённое произведение», «наиболее спорное из когда-либо созданных» или «лучшее аниме всех времен». Своим выходом он завершил «зимнюю эру» аниме-мира и послужил началом третьего аниме-бума . Он вновь вернул интерес к аниме у мужчин, переключившихся на игры. Фигурки Рей Аянами обрели огромную популярность, открывающая тема сериала A Cruel Angel's Thesis стала хитом, а сэйю, озвучивавшие Рей и Аску, прославились как идолы. Как утверждает директор телеканала AT-X Кэйсукэ Ивата, именно Ева привела к широкому распространению японского аниме на мировом рынке. До этого там появлялись в основном лишь такие работы, как Kinpatsu no Jeanie или Moomin, чьё действие разворачивалось за пределами Японии. И по мнению Джейсона Томпсона высказанного в его книге Manga: The Complete Guide, «Евангелион» стал одним из наиболее успешных аниме 1990-х годов. Подобный всплеск популярности крайне удивил автора сериала, Хидэаки Анно. С его точки зрения, сериал не заслуживает подобного успеха, так как все его герои больны.