в деревне-3 мы видим колонию тепловодных пингвинов, расплодившуюся за время, пока синдзи чиллил в космосе. тем временем, мы помним, что пен-пен остался на земле буквально один. каким образом они вообще размножились? в этой части фильма очень жирный лейтмотив зарождения естественной жизни, поэтому вариант с клонированием я отвергаю