Мне кажется, прямо соотносить автора с кем-либо из героев не совсем правильно. Автор может знакомыми вдохновляться, в конце концов, и прочитанной мангой, у него попадались годные отсылочки. Недаром же Урамичи и маскотов сравнивают с Эго, Суперэго и Ид человеческой личности. В них может быть многое намешано от разных людей.
Автор раскрывает Усахару так же, как и остальных, - через поступки. Он хороший, по сути, но изначально двуличный. Он способен делать действительно годные вещи. Только предварительно косячит, и годные поступки призваны его косяки скрыть.
Вот, вы сами это написали. "Ядро" манги, главные герои - как раз Урамичи, Усахара, Куматани. А значит, натягивать на Усахару образ "мальчика из счастливой, здоровой семьи" не совсем корректно. Даже его просвечивающий истинный цвет волос намекает, что с ним не все так просто.
В прошлом Усахара совсем даже не счастлив. Мангака не просто так заставил его рисовать отца вместе с Урамичи и Куматани. И не просто так дал увеличение рисункам его и Мишки.

Раз, и потом - еще крупнее:

Если у ребенка хорошие отношения с отцом, он в жизни его с такими сложными щами и с ножом не нарисует, даже если папа - повар-сушист. И с такой прямой осанкой.
А отец Усахары - другая крайность. Он даже на месте ровно не стоит, его же ведет. Как человек, который точно такую "улыбчивую беззаботность" у дяди наблюдал годами, в обнимку с бутылкой, да, я вам говорю: папа Усахары пьющий. И уделяет больше внимания саке собственной марки, чем сыну. А мама да, заботится, на то она и мама. К маме у него никаких претензий в манге и не было.
Гораздо проще отделаться от сына присланным бухлом (сётю и саке - как раз оно), чем пообщаться с ним лишний раз, особенно если сын в другом городе. Но то, что Усахара с отцом не видится и торчит на квартире Урамичи, вас не настораживает?
Дети в зале смотрят на рисунки и говорят: "Да это ж обычные старые дяди!" Но то дети, а зритель должен быть поумней детей и не вестись на уши нарисованные.
Урамичи еще говорит на Дне отца специально для Усахары и Куматани: "Вам может показаться, что вы совершили ошибку, ослушавшись родителей. Но, если это сделало вас хоть немного счастливее, это не ошибка!" Очень двусмысленно, не находите?
Киото как место рождения Усахары именно для того нужно, что "киотосцы - люди, которые учтивы, но таят под вежливыми словами темные замыслы". По крайней мере, такое о них мнение.
Усахара и так забавный. А "хочу быть забавным, чтоб девки вешались", у него в первый раз всплывает в речи, когда он, сбежав со свидания группового, сконфуженный за Куматани идет и лихорадочно придумывает, что сказать. И даже на той свиданке у него настолько мозги промыты на тему "парень должен встречаться с девушкой", что косится он на Мишку, а сам плетет, что в фильме там "парень с девушкой". А по сути Усахара Мишку на свидание зовет, потом списать чего-то там просит, но на самом деле он клеится к симпатичному парню. И дальше еще ведется на маленького Икетеру. "Это такой школьник?! Вау, клянусь, все девки его!.. Ой, пойду-ка лучше я отсюда".
Когда Куматани остался наедине с Урамичи в своем флешбэке, он сразу угадал, что Урамичи провел каникулы один. И он позвал его с собой в магазин, потому что стало Мишке Урамичи жалко.
В 12 серии экранизированы две главы Усахары и две - Куматани. И в главах от лица Куматани тот точно так же анализирует Урамичи. Насколько может. Потому что у него там в основном Усахара и ревность к Нэкоте. И "Усахара и другие".
Мангака молодец, так тонко и весело подать тот еще пипец надо уметь.