F/GO - это параллельная вселенная, о чём неоднократно упоминалось и в самой игре. Некоторые события могут совпадать, а другие - нет, короче, специально так сделали, чтобы вопросов к несостыковкам не было. Даже не знаю, лучше так, или бесконечные ретконы как у Близзов