Слышите чё думаю.
Мне кажется, авторы просто слушают комьюнити/критиканов/жену продюссера/еще кого-то. А тем вечно нихрена не нравится, замечания всякие.

Что вышло:
1. Первая FLCL заехала всем и каждому, её хвалили за визуальный фарш, сюжетный бред и отменное музло, которое абсолютно волшебно гармонировало со всем остальным, и как будто включалось в какие-то особые моменты.
2. Окей! Сказали авторы и начали крутить все тот же фарш, только ещё забойнее и бредовее, для некоторых это оказалось перебором, а тут ещё и трендолюбы подъехали, посмотрели, не вкурили, появился некоторый градус недовольства: "сложно", или "тупо", или даже "бурда какая-то", и авторы стали заложниками своей же фишки.
3. Окей! Сказали авторы, и попытались как-то чётче обозначить естественный трейс любого мульт/сериала - сюжет. И опять перестарались, градус бредовости упал, происходящее стало проще понимать, основные идеи о юности и её быстротечности выползли наружу, и авторы стали заложниками чьего-то мнения.

Ну это вот так мне кажется после просмотра. Правда, в эту картину несколько не укладывается тот факт, что вторая и третья части не имеют между датами выхода какого-то существенного временного разрыва. И даже больше - первая серия третьей части была слита до выхода второй, так, вроде, было.

Однако, вы можете сделать вывод о колебаниях градуса бреда и степени понятности сюжета из этого текста. Это важный момент.
Что до меня? Я считаю первую часть лучшей. В части глубины проработки персонажей - так точно. Пиндюк, который мутит с бывшей своего брата, которая курит сижки, прогуливает уроки... есть, короче, в этом что-то.

==
UPD
А ещё! Вопрос знатокам - я верно понимаю, что первая часть имеет основу в виде манги=>новеллы, а вторая и третья - нет?