Считаю, что залезать в дебри концовки не слишком нужно ,ибо тут может раскрыться куча вопросов. Но понятно одно - система под контролем, а существа-программы(киборги) там бессмертны, поэтому Кабураги просто копирнули еще раз, наделили телом(или вообще визуализатор условный использовали), и вернули старый аватар.