Увы, но у Мадоки в принципе не может быть хэппиэнда, в привычном нам понимании этого слова. Сюжет так закрутился, что кто-то в итоге всё равно пожертвует собой. Если ты имел ввиду под "в плане сценария" - "в плане лора/мира", то тоже сомнительно, ибо Мадока своим желанием проблему девочек волшебниц толком не решила. Да и сам тайтл, имхо, по большей мере далеко не про мир..
Ну бтв помимо этого 20-секундного эпилога, в котором, кстати, как раз таки была показана Хомура которая УЖЕ использует новую силу, был диалог самой Хмурой с Кьюбеем на крыше, который так и подталкивает сериал к продолжению.