Судя по вашим словам, Мадока-богиня находится теперь не только вне времени и пространства, но также и во всех параллельных мирах одновременно.

Есть два вопроса.

1) Почему у Хомуры, управляющей временем, есть способность к перемещению в параллельный мир?
Возможно это из-за её желания спасти Мадоку, и пока она её не спасёт, то и будет иметь возможность между мирами скакать. Но ладно, это не особо важный вопрос, можно на него закрыть глаза.

2) Второй вопрос - какой информацией и каким сознанием обладает Хомура из Магиреко?
Та Хомура, что находится в Магиреко, уже пробовала спасти Мадоку, переместившись в другой мир?
То есть у нас есть мир Магиреко, где Закон Цикла не работает, и есть бесконечность других миров, где всё ок.
Если она перепрыгнет в мир без барьера, то вообще лол получится - попадёт в мир, где никто не знает Мадоку, притом сама Хомура тоже без понятия, что случилось, ведь про то, что Мадока стала богиней, знает только Хомура с другим сознанием.
Этого можно избежать только тем, что миров с барьером тоже некое множество и Хомура прыгает только по ним.

Отсюда следствие - у Хомуры из Магиреко два варианта.
Первый - это прыгнуть в мир без барьера и тогда произойдёт то, что я выше описал, она ничего не поймёт и непонятно, что она из-за этого решит (скорее всего решит прыгать по мирам дальше, пока не попадёт на мир с барьером, где всё ещё существует Мадока).
Второй вариант - когда она находится в мире с барьером.
В барьере не работает ЗЦ, а значит и Мадока в нём богиней не может ну никак стать, это два противоречащих друг другу события (да и одна Мадока-богиня уже есть, вторая будет выглядеть странно).
Вот и получается, что Хомура из Магиреко либо станет ведьмой от отчаяния, либо найдёт-таки способ спасти Мадоку.

Ну и самое главное - в финале аниме была показана сцена, где Мадока-богиня читала книгу Magia Record, то есть историю мира Магиреко. Получается всё совсем не так, как я считал до инфы о параллельных мирах.
Раньше я думал, что все события Магиреко сотрутся, ибо появится Мадока и спасёт всех. А теперь получается, что нет, всё это происходило в мире, неподвластном Мадоке.
Во-первых, это грустно(
Во-вторых, теперь получается, что Мадока вездесущая богиня, но как бы и не везде. И ей приходится знать печальные истории миров, над которыми у неё нет власти(