Главный герой на протяжении всего аниме поднимается вверх по лестнице, на высшие ярусы, к лифту. Он несколько раз останавливается, отдыхая - и вспоминает события, предшествующие подъёму. Они и составляют большую часть истории.
Рана на щеке появилась позже, когда герой начал подниматься вверх на лифте; герой получил её, когда забирался внутрь.
Турбины - "конусы", скорее всего, являются деталями, которые удерживают "бледный кокон", не давая ему рухнуть. Думаю, это не туман, а пар.
Лифт привёз героя к конечной точке, едва не развалившись. Удержать же массу трос не смог, а потому - разорвался. Возможно, дело так же в гравитации Луны, на уровень действия которой персонаж смог добраться.
Собственно, его не "засасывает в конусы" - он просто начинает парить, попав под действие гравитации Луны.
С атмосферой - спорный вопрос. В самом конце можно заметить, что герой видит Землю через какие-то постройки. Возможно, он находится в той части "бледного кокона", что расположена на поверхности Луны - и там есть атмосфера, позволяющая существовать живым организмам.