Итак, в центре сюжета Человек. Человек, желания которого в отличие от животного (титана) ограничиваются не только инстинктами, но и сознанием - мыслями, чувствами, мышлением. Быть человеком в понимании Исаямы - это не борьба с обстоятельствами, а бесконечный выбор, сражение со своей двойственностью: альтруизм (спасти человечество) или эгоизм (убить всех, но спасти друзей), свобода или рабство, жизнь или смерть, любовь (к Микасе) или ненависть (опять же к Микасе) и т.д. Не стоит забывать, что Эрен - человек, и его мотивы также двойственны, он живёт в постоянных терзаниях этого выбора. Это объясняет сцену в море, когда Эрен говорит Армину, что любит Микасу, хочет быть с ней и не может представить, что она найдёт кого-то другого. Только по-настоящему сильный человек может принять свои слабости и выразить искренность, боль, откровенность. Прямо перед своей смертью Эрен делает выбор в пользу человечества, а не своих животных желаний быть с Микасой. Ведь именно рабская любовь Имир, не способной избавиться от оков и понять это, привела к катастрофе и истреблению мира. Эрен, поцеловав руку Хистории, знал, чем всё обернётся, и осознавал, что завершить этот кошмар можно, если Имир своими глазами увидит и поймёт, что такая же рабская любовь Микасы может освободиться, не потеряв при этом чувств к такому монстру, как Йегер. Убить Эрена удалось только потому что он был отделён он прародителя (вот той голубой многоножки), как бы разделяя свои животные и человеческие желания. Главному герою приходится пожертвовать самым дорогим, что у него есть - своей любовью и свободой. Но не только ему пришлось принести эту жертву: Леви выполнил свой долг перед Эрвином, убив Зика, Эрвин оставил своё желание узнать, что в подвале, Армин завалил Эрена и вынужден налаживать мирные отношения с Марлией, Микаса убила Эрена, разорвав порочный круг.
Исаяма с самого начала аниме и манги оставлял многие вопросы неотвеченными, и концовку сделал открытой, позволяя читателю самому вынести свою мораль и осознать, что в реальном мире (а Атака Титанов очень реалистична в плане морали) не бывает строго героев и антигероев.

• "Райнер, скажи, почему мою маму сожрал титан?"
  Эту фразу говорит Эрен во время разговора в подвале в Марлии. Во-первых, главный герой - это обычный человек, мальчик, на конец манги ему около 18 лет, и последние 5 лет он знал, что никакого другого выхода, кроме смерти у него нет. Он не выбирал родиться у Йегера в семье, становиться атакующим титаном и нести на своих плечах это бремя. Поэтому вопрос должен звучать скорее как "почему МОЮ маму сожрал титан?! Почему на МЕНЯ возложили этот грех, а не на кого-то другого?!" Во-вторых, вопрос риторический, так как Эрен прекрасно знал, что именно он направил титана на свою мать. В противном случае она бы съела Бертольда, и тогда Армин никогда бы не стал Колоссальным титаном и не участвовал в последней битве с Эреном. Кстати, именно поэтому в живых после битвы за Шиганшину должен был остаться не Эрвин, а проницательный Армин, который смог понять чувства Эрена к Микасе и отпустить его, сказав, что его страдания не будут напрасны (сцена в море, опять-таки). Кстати, посмотрите, какой взгляд Армину рисует Исаяма в последних главах манги. Никого не напоминает?
  
• Почему нет ни намёка на любовь Микасы и Эрена? Во-первых, были, когда в конце 50 главы они хотели поцеловаться. Кстати, Исаяма прокомментировал это так: "Когда я нарисовал 50 главу «Крик», редактор Кавакубо сказал: «Я думал, они поцелуются». Я ответил: «Мне неловко заставить их целоваться в такой ситуации». Но это всё потому что я не знал, как их рисовать после поцелуя. Нет, я уверен, Микаса этого хотела. Но я был слишком смущён, чтобы сделать такое." Также был момент, когда Эрен спросил Микасу, кто он да неё, и получил ответ "Семья", чем был явно расстроен. И плюс, все разы когда он её защищал, да и она его. Во-вторых, если бы Эрен дал волю своим чувствам, то Микаса не смогла бы его убить, и мир был бы обречён. Поэтому он держал её на расстоянии вытянутой руки. Это отлично иллюстрирует эпизод разговора Эрена, Микасы и Армина, когда главный герой сказал, что всегда ненавидел Микасу. Не знаю, было ли это толчком к действиям, но эффект свой возымело. В защиту фанатов, хочу сказать, что любовная развязка стала для меня полным шоком. Однако, я считаю, что любовная концовка отлично вписалась в общую концепцию аниме.
  
• Почему Жан и Кони обратно стали людьми?
  Мне кажется, потому что убить Эрена и голубую многоножку-прародителя удалось только по отдельности. Иначе титан-прародитель управлял бы ими и дальше.
  
• Почему убили 80% человечества, а не все 100?
  Напомню, что цель Эрена была в уничтожении всех титанов, а не Микасы, Армина и всех остальных. Убийство 100% мира это бы подразумевало. Также цель была и в примирении Эльдии и Марлии, даже если это не очевидно из его слов, это очевидно из арки про Имир. Оставшиеся 20% должны рассказать о произошедших событиях и нести память будущим поколениям (кстати передача памяти тянется во всех сезонах). Это причина, по которой Леви остался жив, ведь его шрамы и инвалидность - живой пример и прямое напоминание об этих днях.
  
• Зачем нужна Хистория? От кого ребёнок?
  Было бы классно, если бы нам рассказали, чей это ребёнок, но на мой взгляд это не столь важно. Я полагаю, что ребёнок нужен для продолжения рода, то есть рождения потомков, сохранения мира и т.д., а также, возможно, для перерождения освобождённой Имир (или её детей) в этого ребёнка. На последних главах в этом есть символизм: Микаса держит голову Эрена, Хистория в той же позе держит ребёнка. Смерть и жизнь, опять борьба, выбор. К тому же Хистория сыграла роль в передаче памяти и будущего для Эрена. И да, если бы ребёнка Хистории не было, то она бы съела Зика, Эрен и Зик бы не соприкоснулись, Гула бы не было.
  
• Почему раскрыли не всех персонажей?
  Некоторые персонажи должны были сыграть свою роль лишь однажды. Марко - объединение чувства вины Энни, Райнера и Бертольда. Зофия и Удо - для момента с Каей и понимания, что Эльдийцы также теряли своих близких, как и Габи тогда. Елена - как посредник и фанат Зика, девочка, которая забрала шарф Микасы и умирала - чтобы ещё раз обратить внимание на нездоровую привязанность Микасы и так далее.
  
• Мог ли Эрен не умереть?
  Думаю, нет. К этому всё велось всё аниме, да и его жизнь ограничена 13 годами. Он не мог не умереть, иначе бы Имир не освободилась, и ничего бы в мире не изменилось. Рабская любовь должна была умереть.
  
• Причём тут птица?
  Какое животное, как не птица, символизирует свободу? Птицы прослеживаются на протяжении всего аниме, как бы напоминая, что свободы без жертв не будет. Эрен умирает, обретает свободу и перерождается в птицу. Также, скорее всего, птицы также символизируют перемещение во времени, и часто появляются в моментах временных петель (1 кадр: птица, Эрен просыпается под деревом, 2 птицы летят (выбор между 2 вариантами), птица перед разговором Армина и Энни на корабле...) Ну и символ разведотряда - перья, крылья птицы.

На остальные вопросы я либо не знаю ответа, либо просто забыла

Исаяма в действительности очень точно продумал сюжет. Об этом говорят огромное количество подсказок, оставленных в самом начале аниме и манги, заметить которые можно лишь при повторном прочтении. Это подогревает интерес читателя и заставляет поверить мангаке, что это не совпадение, и так было задумано с самого начала. Поэтому концовка не может быть "случайна".
Вот несколько таких моментов:

• Изначально аниме называлось "Атака титанов", но уже по ходу просмотра становится понятно, что название можно перевести и как "Атакующий титан", намекая о тех же животных инстинктах титана, которые двигали Эрена к трагичному финалу. В какой-то момент он даже сказал: "Я не знаю точно, почему хочу этого, но это должно произойти" (примерно так). Что опять говорит нам о том, что Эрен не властен над титаном, его свобода мнимая, и он лишь заложник ситуации (разговор с Армином и Микасой, где они рассуждают о свободе)
  
• Одна из самых странных арок - это неожиданное признание Райнера в том, что он титан. Но если приглядеться, то это не так. Например, в моменте, когда командир на тренировке отчитывает новобранцев, мы видим последовательные кадры Эрена, Райнера, Бертольда, Энни и Эмир (всех титанов) и голос: "Некоторым и не нужно посвящение, ведь 2 года назад они уже прошли через ад". Также, на тренировке по рукопашному бою Райнер отдаёт Эрену нож и говорит: "Твоя очередь быть злодеем", довольно символично.
  Важный момент был в крепости, когда Имир прочитала название сельди на банке, и Райнер понял, что она титан. Но откуда он знал, что такое сельдь, ведь она, как известно, водится в морях, а о море знают лишь те, кто однажды был за стенами.
  И сюда же момент, когда крепость готова была рухнуть, и Бертольд почти укусил себя за руку, чтобы превратиться в титана.
  Внешнее сходство титанов с их владельцами тоже очевидно, особенно на примере Энни.
  
• За стенами существует другой мир. Это становится понятно, когда перед битвой за Шиганшину Армин находит 3 кружки с "непонятным чёрным чаем". Как можно догадаться, это кофе, но его плоды не растут на Парадизе. Ситуация с сельдью сюда же.
  Звероподобный вообще играет в бейсбол (кидается камнями, а Зик играл с отцом в мяч), чего тоже не могло быть на острове. А ещё в кабинете Гриши была электропроводка, что доказывает рождение Гриши в ином мире.
  
• Где-то читала, что число 140 в нумерологии значит свободу и самоосвобождение. Манга заканчивается на 139.5 главе. То есть никто, никто так и не освободился - и Эрен в первую очередь. Честно говоря, мне кажется это совпадением. Но вот 139 глава - это 13 лет и 9 титанов-основателей.
  
• Особо пытливые зрители заметили, что марширующие солдаты в одном из опенингов идут с 39 по 45 секунду (отсылка к ВОВ)

Все эти факты говорят о том, что если бы Исаяма не давал нам этих намёков, то у нас бы возникло много вопросов к существованию мира за стенами, Марлии и Эльдии, а соответственно, и к концовке, которая бы взялась из ни откуда.